A fundação do povoado de Água Limpa teve sua origem essencialmente em função da exploração agrícola das terras bastante férteis da região. Os próceres da comunidade, Francisco Emídio de Oliveira, Antônio da Silva Camargo, José Passos e Adolfo Rosa, doaram uma área de um alqueire para a formação do patrimônio.
O início do povoamento deu-se por volta do ano de 1929, quando João Porfírio Ribeiro ergueu um cruzeiro no local. Em 1945 o povoado foi elevado à categoria de Distrito, tornando-se município em 11 de novembro de 1958. O nome Água Limpa deriva do córrego do mesmo nome existente no local, em cuja margem esquerda acha-se localizada a cidade.
O município conta com uma população de 2.178 habitantes. Está a 205 quilômetros de Goiânia, servido pelas GOs 210 e 405. Possui seis escolas municipais e duas estaduais. As produções de arroz e milho e de leite são a base econômica do município.
Água limpa é banhado pelos rios Corumbá e Piracanjuba, mananciais que lhe conferem condição de município com razoável estrutura turística. As festas populares e religiosas mais importantes comemoradas são as de São João, em 24 de junho; São Sebastião, em 20 de janeiro; São Pedro, em 29 de junho; Santos Reis em 05 de janeiro e Festa do Divino Pai Eterno, em 02 de junho.